南小岛位于北小岛东南，距钓鱼岛约5.5千米，北纬25°43.4′，东经123°33.0′，长约1147米，宽约590米，面积约0.45平方千米，最高海拔约139米。岛体呈椭圆形，东南侧坡度较大，中间大部分为平地。因岛上蛇多，也被称为“蛇岛”。

我国现已公布南小岛和南小岛上1座山峰及周边11个小岛的标准名称。

南小岛三维效果图